1953年童秉纲于哈尔滨工业大学力学专业研究生毕业并留校任教，曾任讲师及理论力学教研室主任，1961年他调到中国科技大学工作，曾先后担任流体力学教研室主任、近代力学系主任，协助钱学森等著名科学家建设了中国科大流体力学的专业教学体系，1981年担任教授，受聘为首批博士生导师，1986年到北京中国科学院研究生院任教至今。童秉纲曾历任中国空气动力学会副会长、副理事长，原国家教委工程力学专业教材委员会委员、教学指导委员会委员和香港理工大学机械工程系顾问委员会委员等职。现担任几个国家重点实验室和中科院开放实验室的学术委员。1997年10月童秉纲当选为中国科学院院士。